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合成生物学——首例人造生命开辟崭新时代

作者:admin 来源:文汇报 更新日期:2010-06-01 11:38 点击:

摘要: 美国生物学家克雷格·文特尔、汉密尔顿·史密斯及其同事在5月20日出版的美国《科学》

杂志上宣布,他们创造了一个人造生命。更准确地说,他们利用实验室里现成的化学物质,制造出

了载有约1000个基因的DNA片断 ...

    美国生物学家克雷格·文特尔、汉密尔顿·史密斯及其同事在5月20日出版的美国《科学》杂

志上宣布,他们创造了一个人造生命。更准确地说,他们利用实验室里现成的化学物质,制造出了

载有约1000个基因的DNA片断。这是自万物起源以来第一个没有祖先的生命,这个名为"辛西

娅"(synthia)的人造生物的诞生,意味着人造生命的时代已经来临。
   
    "科学家对基因修改的研究已有多年,但交换整个基因组则是完全不同的,其他一些研究通常

所作的改变是将少量的基因从细菌中分离。现在我们可以从计算机中提取信息开始,可以从数字代

码开始,以四个实验瓶中的化学物质(指组成DNA的A,T,G,C)创建新的遗传密码,我想这就是最

大的不同。"
   
    ——克雷格·文特尔
   
曲折的创造生命之路
    
    从最基本的生命组件创造一个活生生的有机生命,是文特尔15年前就有的一个雄心勃勃的理想

。纵观以往的生命史,生命的实质就是信息的传递,但是首个人造生命的诞生表明,不需要闪电的

激活,不需要生命的代代相传,就可以让生命从最基本的组件中诞生,从非生命物质到活生生的生

命,相比之下,以往的基因改造只是入门之作,而文特尔在合成生物学上跨出的这一步,才是真正

掌握了操纵生命的艺术。
   
    创造生命的探索之途历经艰难和曲折。一开始,为了少些麻烦,文特尔尽可能地寻找最小的生

物体,并想法将它弄得更小。他起先选择的是一种生殖支原体,一种在生殖道中栖居的生物,是已

知最小的非寄生细菌,只有485个基因,然后,将基因一个个剔除,看它是否还能存活,以确定哪

些基因是可要可不要的,以期以一个更小的生命体来做合成生命的原型。
   
    但这似乎走进了死胡同,虽然可以证明有100个基因并非是必需的,至少在适宜的实验室环境

下可以不需要,但一下子将这些基因全部剔除它却无法存活,找出能够生存的最小的基因组要花许

多时间,因为这种支原体的生长速度十分缓慢。
   
    更重要的是,需要较小基因组的理由也渐渐淡化。DNA合成技术日趋成熟,其价格越来越低,

所以文特尔决定改而采用稍作修改的完整的支原体基因组。
   
    2003年,文特尔合成了病毒Phi-X174的基因组,只有11个基因,但它却并非第一个人工病毒,

一年前,纽约州立大学石溪分校的一个研究小组复制了脊髓灰质炎病毒,不过非常衰弱,只能勉强

繁殖。文特尔合成的病毒却是货真价实的,当病毒DNA注入宿主细胞时,宿主细胞的反应就像感染

了真正的Phi-X174病毒一样。
   
    但是生殖支原体的生长缓慢还是个问题,于是研究小组改用了它亲缘关系相近的丝状支原体,

只是它的DNA是前者的两倍之多,不过以现在的技术这已经不构成什么问题了。为了容易辨别这种

新的菌种的不同,文特尔和他的同事剔除了丝状支原体中他们认为不需要的14个基因,然后加入了

一些他们新设计的DNA,文特尔将这个过程称作"嵌入水印"。
   
    枯燥的实验终于加入了一点有趣的东西。文特尔说,他们嵌入的"水印"中包括一段密码,里面

含有一个网站的网址和三句引文,只要你知道如何解密就行。水印的明文部分标名它是属于文特尔

的,编号为JCVI-syn1.0。
   
    完成重塑的基因组被注入无基因细菌,含有这种细胞的液体被撒在琼脂培养盘中,单个细菌的

生长繁殖会在琼脂上产生斑点,研究人员对一些繁殖茂盛的斑点进行DNA测序,现代基因测序技术

可以迅速完成对支原体基因组的测序,检测结果表明,菌群中确实包含有合成基因组。人造生命的

杰作真的活了!
文特尔:聪明的"园丁"
    
    生物技术有时更像人与自然交流的一种传统方式:园艺。园艺技术主要是通过修剪与嫁接。以

基因为"修剪嫁接"对象的生物技术却遇到了这样的拦路虎:生命体有自己的一套方式,而不管人类

"主人"有什么打算。生物技术中的"修剪"包括去除一些虽对野生生命有好处但却消耗能量,不利完

成指定任务的特性,生物技术中的"嫁接"是添加进从别处转移来的具有某种特性的基因。
   
    文特尔还是希望能回到他最初的设想,通过完整而合理的"修剪嫁接",创造一个最小的基因组

。这个雄心勃勃的设想将成为生物科学的一个新的里程碑,生物技术将从逐个基因操控,发展为一

个以"批量生产"方式改变生命的合成生物学产业。
   
    为此,文特尔就像一个聪明的园丁一样,在过去的十年里锲而不舍地向这个方向努力。显然,

他为细菌互换"零部件"的想法十分成功。细菌族中的每个物种,或一群物种,都有一个由数百个或

数千个基因构成的基因子集,这个基因子集来自于包含了无数个基因的基因库。因此对虽有亲缘关

系但有很大不同的细菌进行比较,可以揭示一种与最小基因组概念类似的"核心能力",以寻求制造

出有实用价值的细菌(比如批量生产某种特效药物)的途径。
   
    文特尔的目光并不仅仅放在细菌上,除了寻求最小基因组之外,他还瞄准了单细胞的藻类。从

单细胞的细菌跨越到单细胞的藻类,听起来是很短的一步。但在生物分类上,藻类与细菌是完全不

同的,这一类生物包括动物、植物、真菌及藻类。
   
    藻类的有趣还体现在其他方面。包括文特尔在内的许多人都想用藻类来制造生物燃料。它们可

将大气中和发电站排气中的二氧化碳,通过光合作用转化为石油或柴油。目前几乎所有用来生产生

物燃料的微生物都是通过发酵作用来实现这一目的的,利用藻类就可以省掉一些中间步骤。
   
    文特尔的目的是要实现对细菌基因组的全面控制,将研究对象扩大到各种不同的微生物。他麾

下的合成基因组公司已和Exxon签约,将由其斥资6亿美元,从藻类中制作生物燃料。文特尔表示要

努力"建立完整的藻类基因组,这样我们就可以改变藻类生长中50%-60%的参数,藉以形成各种超多

产的有机体。"到目前为止,通过对众多海水微生物DNA的分析,文特尔已拥有约4千万种基因的库

存,其中大部分源自于藻类。他说,这些基因将是一笔可观的资源,足以使捕获的藻类产生有用的

化学物质。
   
未来生命科学展望
    
    然而,科学家的所有这些设想和努力,都要取决于一个因素:合成DNA价格的持续下降。这与

戈登·摩尔关于电脑发展的著名定律很有些相似,过去十年里DNA测序和DNA修改的价格都在直线下

跌。前者意味着世界上的DNA数据库里已有了生命之树各部分的大量基因数据,后者意味着这些基

因的剪切粘贴都在变得越来越便捷容易。
   
    合成生物学作为一种正在"起飞"的技术,不仅是件好事,而且于人类至关重要。创造一种新的

实用生物体的过程将会是一种不断失败不断尝试的曲折过程,人工选择的进化方式很可能会像自然

选择一样,浪费大量的资源。但很多人对基因合成的繁殖方式有所担忧,君不见电脑黑客制造的电

脑"病毒"给人们带来多大的烦恼,他们担心,未来的黑客们也许会利用合成生物学,制造出真正的

病毒。
   
    无疑,这是一种风险。但几乎所有技术都一样,既可用来行善,也可用来作恶。用来制造病原

体的技术也可用来制造疫苗。既能行善,且能带来利益的事,总是比邪恶的欲望更能吸引更多的人

,如此说法并非盲目乐观。利用合成生物学,人们可以发明新的作物、新的燃料、新的疾病治疗方

法和新的药物。当然,也可能会有人利用合成生物学技术做一些疯狂的事情。
   
    在科幻小说迈克尔·克莱顿的《侏罗纪公园》中,展现了恐龙复活的惊人场景,但实际上,没

有任何办法利用存活下来的DNA直接让生命复活。但是如今人类已经有了成功制造出基因组的能力

,加上对复杂生物体有了更为深刻的理解,相信总有一天,合成生物学将能制造出做出类似恐龙的

生物。
   
    不过,虽然恐龙没有留下可用的DNA,其他更晚灭绝的生物却慷慨地给予了我们机会,想像一

下,将合成生物学用于目前已完成测序的尼安德特人的基因组,再与现代人类的DNA相比较一下,

看看有什么根本的不同,这是多么令人兴奋的事情。如果能够创造出一个尼安德特人出来,再亲口

问他一些问题,那将多有意思!不过,如果这种做法会引起伦理道德上的争议的话,不妨来只远古

猛犸象试试怎么样?
   
来源:文汇报

 

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